inovmedИнновационная медицина КубаниInnovative Medicine of Kuban2541-9897Scientific Research Institute – Ochapovsky Regional Clinical Hospital No. 110.35401/2541-9897-2025-10-1-49-55inovmed-1065Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESАнализ экспрессии некоторых микроРНК в образцах пациентов с диагнозом меланома кожиAnalysis of MicroRNA Expression in Specimens From Patients With Cutaneous Melanomahttps://orcid.org/0009-0004-9311-7175СтефановаЮ. Ю.StefanovaJulia Ju.

Стефанова Юлия Юрьевна, врач-радиолог, онколог, радиотерапевт, аспирант

350063, Краснодар, ул. М. Седина, 4

Julia Ju. Stefanova, Radiologist, Oncologist, Radiotherapist, Postgraduate Student

ulitsa M. Sedina 4, Krasnodar, 350063

stefanovajulia676@rambler.ruhttps://orcid.org/0009-0005-0655-0980ПорхановаН. В.PorhanovaNatalya V.

Порханова Наталья Владимировна, д. м. н., доцент, заведующая отделением онкогинекологии

Краснодар

Natalya V. Porhanova, Dr. Sci. (Med.), Associate Professor, Head of the Gynecologic Oncology Unit

Krasnodar

https://orcid.org/0000-0001-8873-8461МурашкоР. А.MurashkoRoman A.

Мурашко Роман Алексеевич, к. м. н., главный врач

Краснодар

Roman A. Murashko, Cand. Sci. (Med.), Chief Physician

Krasnodar

https://orcid.org/0000-0002-5945-5961ТимофееваС. В.TimofeevaSofia V.

Тимофеева Софья Владимировна, научный сотрудник

Ростов-на-Дону

Sofia V. Timofeeva, Researcher

Rostov-on-Don

https://orcid.org/0000-0002-9471-3903МаксимовА. Ю.MaksimovAleksey Yu.

Максимов Алексей Юрьевич, д. м. н., профессор, заместитель генерального директора по перспективным научным разработкам

Ростов-на-Дону

Aleksey Yu. Maksimov, Dr. Sci. (Med.), Professor, Deputy Director General for Promising Scientific Developments

Rostov-on-Don

https://orcid.org/0000-0003-0572-1395ПорхановВ. А.PorhanovVladimir A.

Порханов Владимир Алексеевич, д. м. н., профессор, академик РАН, заведующий кафедрой онкологии с курсом торакальной хирургии ФПК и ППС; главный врач

350063, Краснодар, ул. М. Седина, 4

Vladimir A. Porhanov, Dr. Sci. (Med.), Professor, Academician of the Russian Academy of Sciences, Head of the Oncology Department with the Thoracic Surgery Course, Faculty of Continuing Professional Development and Retraining; Chief Physician

ulitsa M. Sedina 4, Krasnodar, 350063

Krasnodar

Кубанский государственный медицинский университетРоссияKuban State Medical UniversityRussian FederationКлинический онкологический диспансер № 1РоссияClinical Oncological Dispensary No. 1Russian FederationНациональный медицинский исследовательский центр онкологииРоссияNational Medical Research Center for OncologyRussian FederationКубанский государственный медицинский университет; Научно-исследовательский институт – Краевая клиническая больница № 1РоссияKuban State Medical University; Scientific Research Institute – Ochapovsky Regional Clinical Hospital No. 1Russian Federation2025300320251014955Copyright © Стефанова Ю.Ю., Порханова Н.В., Мурашко Р.А., Тимофеева С.В., Максимов А.Ю., Порханов В.А., 20252025Стефанова Ю.Ю., Порханова Н.В., Мурашко Р.А., Тимофеева С.В., Максимов А.Ю., Порханов В.А.Stefanova J.J., Porhanova N.V., Murashko R.A., Timofeeva S.V., Maksimov A.Y., Porhanov V.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.innovmedkub.ru/jour/article/view/1065Актуальность

Актуальность: Меланома кожи считается самой смертоносной формой рака кожи среди всех злокачественных новообразований этого органа. На сегодняшний день, по данным современной литературы, эффективному лечению меланомы препятствуют проблемы, связанные с точным прогнозированием и ранним выявлением рецидивов. За последние 20 лет исследователи часто отмечают роль микроРНК как модулятора различных биологических процессов. Нарушение экспрессии и активности микроРНК может способствовать риску развития злокачественных новообразований, в том числе и меланомы кожи, поэтому в нашем исследовании мы решили изучить некоторые микроРНК в качестве биомаркеров для будущего применения в диагностике опухоли кожи.

Цель

Цель: Проанализировать экспрессию микроРНК микроРНК-205, микроРНК-199a-3p, микроРНК-146a-5p в опухолевом материале пациентов с диагнозом меланома кожи.

Материалы и методы

Материалы и методы: Нами количественно оценивалась экспрессия микроРНК-205, микроРНК-199a-3p, микроРНК-146a-5p с помощью метода ПЦР в реальном времени в биоптатах пациентов с меланомой (n=14). Для всех образцов была выбрана величина порогового значения Ct – 0,1 (программа qPCRsoft 3.0). Статистический анализ выполнен с помощью программы Statistica 7,0. Дополнительно проведен биоинформационный поиск генов-мишеней микро-РНК с помощью программы DIANA-mirPath v.3.0 (DIANA-Lab, Греция) и построены генные сети их взаимодействия при помощи STRING (https://string-db.org/).

Результаты

Результаты: В результате исследования в группе больных меланомой кожи идентифицировали 2 из 3-х исследуемых микроРНК: микроРНК-205, микроРНК-146a-5p. В обеих группах – контрольной и группе пациентов с меланомой – идентифицирована 1 из 3-х исследуемых микроРНК – miR-146a-5p. Показатель ∆Ctср микроРНК-146a-5p составил 3,81±2,03 в контрольной группе и 2,26±1,34 – у пациентов с меланомой. Из-за широкого разброса значений в контрольной группе и группе пациентов с меланомой кожи микроРНК miR-146a-5p нельзя рассматривать в качестве информативного биомаркера. В то же время нами выявлено высокое значение экспрессии микроРНК-205 в группе пациентов с меланомой кожи.

Выводы

Выводы: Таким образом, установлено, что особую ценность для диагностики меланомы может представлять микроРНК-205. Однако необходимы дополнительные исследования с увеличением выборки пациентов и дополнительной стратификацией по гистопатологическим особенностям.

Importance

Importance: Cutaneous melanoma is regarded as the most lethal form of skin cancer. According to the literature, issues associated with accurate prognosis and early detection of relapses hinder effective treatment of melanomas. Over the past 20 years, microRNAs have been shown to modulate various biological processes. Disruption of microRNA expression and activity can contribute to the risk of cancer development, including cutaneous melanoma. Therefore, we decided to study some microRNAs as biomarkers for future use in cutaneous melanoma diagnosis.

Objective

Objective: To analyze the expression of microRNA-205, microRNA-199a-3p, microRNA-146a-5p in tumor tissue of patients diagnosed with cutaneous melanoma.

Materials and methods

Materials and methods: We quantified the expression of microRNA-205, microRNA-199a-3p, microRNA-146a-5p using the realtime polymerase chain reaction in biopsy specimens from patients with melanoma (n=14). For all the specimens, the cycle threshold (Ct) value was 0.1 (qPCRsoft 3.0, Analytik Jena, Germany). Statistical analysis was performed using Statistica 7.0 (StatSoft, USA). Furthermore, we conducted a bioinformatics search for microRNA target genes using DIANA-mirPath v.3.0 (DIANA-Lab, Greece) and constructed gene interaction networks using STRING (https://string-db.org/).

Results

Results: We detected 2 of 3 microRNAs in the group of patients with cutaneous melanoma: microRNA-205 and microRNA-146a-5p. In both the control group and the group of patients with melanoma, 1 of 3 microRNAs, namely miR-146a-5p, was found. The mean ∆Ct value of microRNA-146a-5p was 3.81±2.03 in the control group and 2.26±1.34 in the patients with melanoma. Due to the wide range of values in the control group and the group of patients with cutaneous melanoma, microRNA-146a-5p cannot be considered an informative biomarker. At the same time, we found high expression of microRNA-205 in the group of patients with cutaneous melanoma.

Conclusions

Conclusions: microRNA-205 was found to be valuable in melanoma diagnosis. However, further studies with larger sample size and additional stratification by histopathological features are needed.

меланомамикроРНКмикроРНК-205микроРНК-199a-3pмикроРНК-146a-5pmelanomamicroRNAmicroRNA-205microRNA-199a-3pmicroRNA-146a-5pReferencesСтефанова Ю.Ю., Порханова Н.В., Мурашко Р.А., Тимошкина Н.В., Максимов А.Ю., Тимофеева С.В. Мутационный статус генов BRAF, NRAS в опухолевом материале пациентов с диагнозом меланома кожи. Медицинская генетика. 2024;23(7):51–56.Stefanova YuYu, Porkhanova NV, Murashko RA, Timoshkina NV, Maksimov AYu, Timofeeva SV. Mutational status of BRAF, NRAS genes in tumor material of patients diagnosed with cutaneous melanoma. Medical Genetics. 2024;23(7):51–56. (In Russ.).Negrini M, Ferracin M, Sabbioni S, Croce CM. MicroRNAs in human cancer: from research to therapy. J Cell Sci. 2007;120(Pt 11):1833– 1840. PMID: 17515481. https://doi.org/10.1242/jcs.03450NegriniM, FerracinM, SabbioniS, CroceCM. MicroRNAs in human cancer: from research to therapy. J Cell Sci. 2007;120(Pt 11):1833– 1840. PMID: 17515481. https://doi.org/10.1242/jcs.03450Bertoli G, Cava C, Castiglioni I. MicroRNAs: new biomarkers for diagnosis, prognosis, therapy prediction and therapeutic tools for breast cancer. Theranostics. 2015;5(10):1122–1143. PMID: 26199650. PMCID: PMC4508501. https://doi.org/10.7150/thno.11543Bertoli G, Cava C, Castiglioni I. MicroRNAs: new biomarkers for diagnosis, prognosis, therapy prediction and therapeutic tools for breast cancer. Theranostics. 2015;5(10):1122–1143. PMID: 26199650. PMCID: PMC4508501. https://doi.org/10.7150/thno.11543Durante G, Broseghini E, Comito F, et al. Circulating microRNA biomarkers in melanoma and non-melanoma skin cancer. Expert Rev Mol Diagn. 2022;22(3):305–318. PMID: 35235479. https://doi.org/10.1080/14737159.2022.2049243Durante G, Broseghini E, Comito F, et al. Circulating microRNA biomarkers in melanoma and non-melanoma skin cancer. Expert Rev Mol Diagn. 2022;22(3):305–318. PMID: 35235479. https://doi.org/10.1080/14737159.2022.2049243Петкевич А.А., Шубина И.Ж., Абрамов А.А., Мамедова Л.Т., Самойленко И.В., Киселевский М.В. Особенности экспрессии микроРНК в меланоцитах и клетках меланомы человека. Российский биотерапевтический журнал. 2018;17(3):6– 11. https://doi.org/10.17650/1726-9784-2018-17-3-6-11.Petkevich AA, Shubina IZh, Abramov AA, Mamedova LT, Samoilenko IV, Kiselevsky MV. MicroRNA expression in melanocytes and melanoma cells. Russian Journal of Biotherapy. 2018;17(3):6–11. (In Russ.). https://doi.org/10.17650/1726-9784-2018-17-3-6-11Dar AA, Majid S, de Semir D, Nosrati M, Bezrookove V, Kashani-Sabet M. miRNA-205 suppresses melanoma cell proliferation and induces senescence via regulation of E2F1 protein. J Biol Chem. 2011;286(19):16606–16614. PMID: 21454583. PMCID: PMC3089503. https://doi.org/10.1074/jbc.M111.227611Dar AA, Majid S, de Semir D, Nosrati M, Bezrookove V, Kashani-Sabet M. miRNA-205 suppresses melanoma cell proliferation and induces senescence via regulation of E2F1 protein. J Biol Chem. 2011;286(19):16606–16614. PMID: 21454583. PMCID: PMC3089503. https://doi.org/10.1074/jbc.M111.227611Liu S, Tetzlaff MT, Liu A, Liegl-Atzwanger B, Guo J, Xu X. Loss of microRNA-205 expression is associated with melanoma progression. Lab Invest. 2012;92(7):1084–1096. PMID: 22525428. https://doi.org/10.1038/labinvest.2012.62Liu S, Tetzlaff MT, Liu A, Liegl-Atzwanger B, Guo J, Xu X. Loss of microRNA-205 expression is associated with melanoma progression. Lab Invest. 2012;92(7):1084–1096. PMID: 22525428. https://doi.org/10.1038/labinvest.2012.62Zhang Y, Zhao J, Ding M, et al. Loss of exosomal miR146a-5p from cancer-associated fibroblasts after androgen deprivation therapy contributes to prostate cancer metastasis. J Exp Clin Cancer Res. 2020;39(1):282. PMID: 33317606. PMCID: PMC7734763. https://doi.org/10.1186/s13046-020-01761-1Zhang Y, Zhao J, Ding M, et al. Loss of exosomal miR146a-5p from cancer-associated fibroblasts after androgen deprivation therapy contributes to prostate cancer metastasis. J Exp Clin Cancer Res. 2020;39(1):282. PMID: 33317606. PMCID: PMC7734763. https://doi.org/10.1186/s13046-020-01761-1Ghafouri-Fard S, Gholipour M, Taheri M. MicroRNA Signature in melanoma: biomarkers and therapeutic targets. Front Oncol. 2021;11:608987. PMID: 33968718. PMCID: PMC8100681. https://doi.org/10.3389/fonc.2021.608987Ghafouri-Fard S, Gholipour M, Taheri M. MicroRNA Signature in melanoma: biomarkers and therapeutic targets. Front Oncol. 2021;11:608987. PMID: 33968718. PMCID: PMC8100681. https://doi.org/10.3389/fonc.2021.608987Szklarczyk D, Kirsch R, Koutrouli M, et al. The STRING database in 2023: protein-protein association networks and functional enrichment analyses for any sequenced genome of interest. Nucleic Acids Res. 2023;51(D1):D638–D646. PMID: 36370105. PMCID: PMC9825434. https://doi.org/10.1093/nar/gkac1000Szklarczyk D, Kirsch R, Koutrouli M, et al. The STRING database in 2023: protein-protein association networks and functional enrichment analyses for any sequenced genome of interest. Nucleic Acids Res. 2023;51(D1):D638–D646. PMID: 36370105. PMCID: PMC9825434. https://doi.org/10.1093/nar/gkac1000Hwang SJ, Seol HJ, Park YM, et al. MicroRNA-146a suppresses metastatic activity in brain metastasis. Mol Cells. 2012;34(3):329–334. PMID: 22949171. PMCID: PMC3887840. https://doi.org/10.1007/s10059-012-0171-6Hwang SJ, Seol HJ, Park YM, et al. MicroRNA-146a suppresses metastatic activity in brain metastasis. Mol Cells. 2012;34(3):329–334. PMID: 22949171. PMCID: PMC3887840. https://doi.org/10.1007/s10059-012-0171-6Pu W, Shang Y, Shao Q, Yuan X. miR-146a promotes cell migration and invasion in melanoma by directly targeting SMAD4. Oncol Lett. 2018;15(5):7111–7117. PMID: 29731876. PMCID: PMC5921230. https://doi.org/10.3892/ol.2018.8172Pu W, Shang Y, Shao Q, Yuan X. miR-146a promotes cell migration and invasion in melanoma by directly targeting SMAD4. Oncol Lett. 2018;15(5):7111–7117. PMID: 29731876. PMCID: PMC5921230. https://doi.org/10.3892/ol.2018.8172Vergani E, Dugo M, Cossa M, et al. miR-146a-5p impairs melanoma resistance to kinase inhibitors by targeting COX2 and regulating NFkB-mediated inflammatory mediators. Cell Commun Signal. 2020;18(1):156. PMID: 32967672. PMCID: PMC7510138. https://doi.org/10.1186/s12964-020-00601-1Vergani E, Dugo M, Cossa M, et al. miR-146a-5p impairs melanoma resistance to kinase inhibitors by targeting COX2 and regulating NFkB-mediated inflammatory mediators. Cell Commun Signal. 2020;18(1):156. PMID: 32967672. PMCID: PMC7510138. https://doi.org/10.1186/s12964-020-00601-1Pencheva N, Tran H, Buss C, et al. Convergent multimiRNA targeting of ApoE drives LRP1/LRP8-dependent melanoma metastasis and angiogenesis. Cell. 2012;151(5):1068–1082. PMID: 23142051. PMCID: PMC3753115. https://doi.org/10.1016/j.cell.2012.10.028Pencheva N, Tran H, Buss C, et al. Convergent multimiRNA targeting of ApoE drives LRP1/LRP8-dependent melanoma metastasis and angiogenesis. Cell. 2012;151(5):1068–1082. PMID: 23142051. PMCID: PMC3753115. https://doi.org/10.1016/j.cell.2012.10.028Sánchez-Sendra B, Serna E, Navarro L, et al. Transcriptomic identification of miR-205 target genes potentially involved in metastasis and survival of cutaneous malignant melanoma. Sci Rep. 2020;10(1):4771. PMID: 32179834. PMCID: PMC7075905. https://doi.org/10.1038/s41598-020-61637-4Sánchez-Sendra B, Serna E, Navarro L, et al. Transcriptomic identification of miR-205 target genes potentially involved in metastasis and survival of cutaneous malignant melanoma. Sci Rep. 2020;10(1):4771. PMID: 32179834. PMCID: PMC7075905. https://doi.org/10.1038/s41598-020-61637-4Aksenenko M, Palkina N, Komina A, Tashireva L, Ruksha T. Differences in microRNA expression between melanoma and healthy adjacent skin. BMC Dermatol. 2019;5;19(1):1. PMID: 30611259. PMCID: PMC6321655. https://doi.org/10.1186/s12895-018-0081-1.Aksenenko M, Palkina N, Komina A, Tashireva L, Ruksha T. Differences in microRNA expression between melanoma and healthy adjacent skin. BMC Dermatol. 2019;5;19(1):1. PMID: 30611259. PMCID: PMC6321655. https://doi.org/10.1186/s12895-018-0081-1.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.